不同的细胞器在细胞中所处的地位是不同的，细胞核是细胞的中心，对细胞有着控制权，对于安全性的要求也较高，因此要想从细胞核的外部进入细胞核的内部需要通过特殊的核孔复合物，并且通过特殊的Ran介导的方式入核。
[[File:城市运输3.png|800px]] [[File:Clathrin.PNG|800px]] [[File:COPIICOPI.PNG|600px]] [[File:COPII.PNG|400px]]
从高尔基体到胞内体或者从细胞外到胞内体是细胞中运输通量相对较大的运输路径，因此选择了Clathrin介导的膜泡运输，由于形成Clathrin包裹的小泡的原料分布范围很大，因此能够介导大量的运输，而COPII介导的从内质网到高尔基体以及COPI介导的从高尔基体到内质网则相对运输通量较小。