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《超越学科的认知基础》2015颜峻学习报告-第八周

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[[File:逻辑模型图片.PNG|600px]]
 
 
{|border=1
|+
|'''过程'''
|'''时间安排'''
|-
|学习Wolfram Language
|2015.11.15-17
|-
|选择数据库
|2015.11.18-19
|-
|构建程序的基本架构
|2015.11.20-22
|-
|程序编写与调试
|2015.11.23-25
|-
|}
=====效果=====
神经网络算法是一项根据人脑的结构和思维方式构建的一种算法,试图使得计算机拥有逻辑性的思维。'''[1]'''神经算法虽然起步较晚,发展较慢,但是在某些方面,它展示出了强大的威力。类似的,细胞因子之间的网络错综复杂,但是却能够高度有序地传递信息,这表明其中一定存在某种模式,这种模式能够帮助细胞快速有效地传递信息。通过对细胞中的肿瘤调控因子网络的研究能够帮助我们提炼出一种新的算法模式。
[[File:神经网络.PNG|160px]] [[File:神经网络2.PNG|160px]] [[File:程序.PNG|250px]][[File:wolfram函数.PNG|250px]] [[File:wolfram.PNG|250px]]
=====输出=====
=====活动=====
 
[[File:第八周颜峻 活动.png|1000px]]
 
#首先需要学习Wolfram Language (希望老师能够提供一些有关Wolram语言架构的介绍)
#学习Mathematica的使用,特别是笔记本和演示项目的使用
#学会基本的编程方式
#选择合适的数据库,如:PDB[http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do] '''[5]''' Genbank[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/] '''[6]'''等等
#选择合适的程序架构
#绘制出关系图
#分析细胞因子调节的模式
#类比提出算法
 
=====输入=====
#软件资源 Wolfram Mathematica, Wolfram Alpha, Github, Teambition等等
#图书馆资源,特别是Springer[http://link.springer.com/]和Wiley[http://onlinelibrary.wiley.com/]
#印刷本图书,如< the Biology of Cancer>[http://www.garlandscience.com/product/isbn/9780815342205]
#网络教程
#Wiki
 
[[File:springer.PNG|200px]] [[File:wiley.PNG|200px]] [[File:tboc.jpg|160px]]
 
=====背景=====
超越学科的认知基础课能够给我们一个使用Mathematica以及Wolfram Language的环境,同时我对肿瘤的产生特别是因子调控有着强烈的兴趣
 
=====目标=====
将肿瘤因子数据库导入Mathematica,绘制各个因子之间的关系图,通过高级的图论算法得到调控的基本模式,类比神经算法提出一种新的算法
 
=====外部因素=====
#课业压力,期中考试
#软件的学习
#时间安排压力
 
====关键人物====
#Stephen Wolfram[https://en.wikipedia.org/wiki/Stephen_Wolfram]#A.Robert Weinberg [https://en.wikipedia.org/wiki/Robert_Weinberg]#W·Mcculloch#W·Pitts [https://en.wikipedia.org/wiki/Michael_William_Pitt]#John von Neumann [https://en.wikipedia.org/wiki/John_von_Neumann]#F·Rosenblatt#John Hopfield [https://en.wikipedia.org/wiki/John_Hopfield]
====关键技术====
# Wolfram Language [https://en.wikipedia.org/wiki/Wolfram_Language]
# Wolfram Mathematica [https://en.wikipedia.org/wiki/Mathematica]
# Artificial Neural Algorithm [http://baike.baidu.com/link?url=MZOfLLC0AoRV43ITAw8F2R3Ww8lHb8mDh2g5un2L9A26P2lAsFRlvzQUk9TelZlN_0AeK2lO8vedSlCi_JuD4q]
# Artificial Neural Network [https://en.wikipedia.org/wiki/Artificial_neural_network]
# Hopfield神经网络 [http://baike.baidu.com/link?url=-Aggedv60HX-iLcLldf2LeFS6Q-PIiMdOzmUYOmf2dFCWpG9sealIuG4gohLxHGn2kCjtG8ZSj9UOJF8N1mdmK]
# 模拟退火算法 [http://baike.baidu.com/view/18185.htm]
 
====关键组织和制度====
# Whitehead Institution [https://en.wikipedia.org/wiki/Whitehead_Institute]
# Wolfram Int.
# Massachusetts Institute of Technology (MIT)
# Springer
# Wiley
# Genbank
# PDB
# Garland Science
 
===参考文献===
#Artificial Neural Networks Method and Applications in Bio-/Neuroinformatics[M]. Petia Koprinkova-Hristova, Valeri Mladenov, Nikola K. Kasabov. ISBN: 978-3-319-09902-6 (Print) 978-3-319-09903-3 (Online)
#http://demonstrations.wolfram.com/HepatocellularCarcinomaGeneProteinNetworks/
#http://www.wolfram.com/language/?source=frontpage
#http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
#http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
#http://link.springer.com/
#http://onlinelibrary.wiley.com/
#''the Biology of Cancer'' [M] A. Robert Weinberg.
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